深圳市眼科医院创建于1983年，是深圳市唯一一家三级甲等市属公立眼科专科医院。医院是集医疗、教学、科研为一体的现代化眼病防治专科医院，是深圳市眼病防治研究所、深圳市眼科学重点实验室、深圳眼库、深圳市眼科学培训中心的依托单位，是深圳市博士后创新实践基地及广东省两家“中国日间手术联盟”医院之一，是深圳市医防融合眼科学项目组牵头单位。
医院为眼科专科医院，下设11个亚专科，其中市级重点学科2个（眼底病科、青光眼与神经眼科），市级特色学科1个（中医眼科）。共设置职能管理科室10个，业务管理科室15个，医技及其他科室6个。
医院眼科学为广东省高水平临床重点学科，在国内首次引进Peli眼镜治疗视野缺损患者，并成立深圳市儿童青少年近视防控中心，推动深圳市青少年近视防控工作开展。同时，医院肩负健康宣教职责，是中国健康管理协会个案管理分会常务理事单位，广东省健康教育协会医院健康促进工作委员会理事单位。
目前，医院与美国加州大学伯克利分校眼科视光学院、美国迈阿密大学、英国伯明翰城市大学、美国加州大学旧金山分校医学中心眼科学院、美国科罗拉多大学等建立友好合作关系，累计选送50余人次到海外进修学习。
根据《深圳市国民经济和社会发展第十三个五年规划纲要》、《深圳市 2018 年政府投资项目计划》要求，结合医院总体发展规划，扩大医院建设规模，着眼当前，立足长远，以“高起点、高标准”的要求规划医院，建设总体300张床位。一期已开放200张床位，本期增设100张床位。解决 医院病床长期超负荷运行问题及提升医院收治病人的能力，提高诊治效率。同时解决医院科教用房面积不足的问题，提高医院综合科研能力，为培养高技能型人才提供良好平台，为医院医、教、研一体化发展提供有力支撑，把眼科医院建设成为国内国际一流的、现代化眼科防治专科医院。
未来，医院将打造立足先行示范区，辐射粤港澳大湾区的眼健康服务基地和眼科人工智能产业生态谷，探索建设深圳市视光学院和眼健康预防研究所，完善全民眼病预防与眼健康促进服务体系，助力推进“健康中国”建设的深圳实践。
